Gynaecologische tumoren
Vrouwen met Fanconi anemie (FA) hebben een verhoogde kans op kanker van de geslachtsorganen (vulva, vagina en baarmoederhals). Ook komt kanker van de anus vaker voor. Na een stamceltransplantatie is de kans mogelijk nog hoger. Het is daarom belangrijk dat vrouwen met FA zich vanaf de eerste menstruatie regelmatig (in principe jaarlijks) laten onderzoeken.
Humaan Papillomavirus
Het humaan papillomavirus (HPV) is het meest voorkomende seksueel overdraagbare virus. HPV kan (ano)genitale wratten en slijmvlieskanker van de vrouwelijke geslachtsorganen veroorzaken. Daarom worden meisjes vanaf 12 jaar tegen HPV ingeënt. Inentingen zijn niet verplicht maar meisjes met FA wordt ten sterkste aangeraden zich in te laten enten. Dat geldt ook voor jongens met FA omdat zij het virus kunnen dragen, overbrengen en er zelf last van kunnen hebben.